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867, multiscale, ongoing, e1002937, constraints, enables, simultaneous, modules, hubs, krützelmann, 215, 218, extent, deficit, does, relate, visibility, fluid, attenuated, inversion, bravo, ding, juvenile, late, infantile, ceroid, lipofuscinosis, teach, making, 1147, diffeomorphic, blendowski, 257, range, noise, dimensionality, holmes, 0j1, incorporate, variability, 4247, fields, intensity, 1390, aligning, rigid, toussaint, maiz, coynel, souza, sarazin, habert, 778, 786, normal, ageing, entropy, 813, 819, abnormality, mca, occlusion, likelihood, later, recanalization, insight, algorithmen, systeme, anwendungen, klassifikation, verschlussgrades, epiphyse, proximalen, tibia, altersbestimmung, rosso, arbizu, ferrieux, vargas, humbert, attal, zavanone, meunier, cohen, thielscher, siebner, samson, stimul, 129, inferior, gyrus, supplementary, cathodal, tdcs, picture, naming, speed, roland, polzin, rühaak, 250, landmarks, kombination, atemsignalen, optimierung, prädiktion, komplexer, 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hetelig d werner r schröder k carty m bowie a huber s meier c mittrücker h heeren j krause k flügel a diercks b guse a sci signal 2021 14 709 spatio temporal feature learning with reservoir computing for t cell segmentation in live cell ca2 fluorescence microscopy hadaeghi f diercks b schetelig d damicelli f wolf i werner r sci rep uk 2021 11 1 paip 2019 liver cancer segmentation challenge kim y jang h lee k park s min s hong c park j lee k kim j hong w jung h liu y rajkumar h khened m krishnamurthi g yang s wang x han c kwak j ma j tang z marami b zeineh j zhao z heng p schmitz r madesta f rösch t werner r tian j puybareau e bovio m zhang x zhu y chun s jeong w park p choi j med image anal 2021 67 101854 single image based vignetting correction for improving the consistency of neural activity analysis in 2 photon functional microscopy li d wang g werner r xie h guan j hilgetag c front neuroinform 2021 15 674439 game theoretical mapping of fundamental brain functions based on lesion deficits in acute stroke malherbe c cheng b königsberg a cho t ebinger m endres m fiebach j fiehler j galinovic i puig j thijs v lemmens r muir k nighoghossian n pedraza s simonsen c wouters a gerloff c hilgetag c thomalla g brain commun 2021 3 3 fcab204 deep learning based automated thrombolysis in cerebral infarction scoring a timely proof of principle study nielsen m waldmann m frölich a flottmann f hristova e bendszus m seker f fiehler j sentker t werner r stroke 2021 52 11 3497 3504 modelling the effect of deep brain stimulation on cortico subcortical networks in the context of freezing of gait in parkinson s disease popova m messe a gulberti a pötter nerger m hilgetag c j comput neurosci 2021 2021 49 s86 hn1l jpt2 a signaling protein that connects naadp generation to ca2 microdomain formation roggenkamp h khansahib i hernandez c l zhang y lodygin d krüger a gu f möckl f löhndorf a wolters v woike d rosche a bauche a schetelig d werner r schlüter h failla a meier c fliegert r walseth t flügel a diercks b guse a sci signal 2021 14 675 multi scale fully convolutional neural networks for histopathology image segmentation from nuclear aberrations to the global tissue architecture schmitz r madesta f nielsen m krause j steurer s werner r rösch t med image anal 2021 70 101996 functional connectivity changes in cerebral small vessel disease a systematic review of the resting state mri literature schulz m malherbe c cheng b thomalla g schlemm e bmc med 2021 19 1 103 first clinical evaluation of breathing controlled four dimensional computed tomography imaging szkitsak j werner r fernolendt s schwarz a ott o fietkau r hofmann c bert c phys imag radiat onc 2021 20 56 61 two classes of functional connectivity in dynamical processes in networks voutsa v battaglia d bracken l brovelli a costescu j díaz muñoz m fath b funk a guirro m hein t kerschner c kimmich c lima v messé a parsons a perez j pöppl r prell c recinos s shi y tiwari s turnbull l wainwright j waxenecker h hütt m j r soc interface 2021 18 183 20210486 comparison of intelligent 4d ct sequence scanning and conventional spiral 4d ct a first comprehensive phantom study werner r szkitsak j sentker t madesta f schwarz a fernolendt s vornehm m gauer t bert c hofmann c phys med biol 2021 66 1 time dependent image restoration of low snr live cell ca2 fluorescence microscopy data woelk l kannabiran s brock v gee c lohr c guse a diercks b werner r int j mol sci 2021 22 zum forschungsportal 3d smrnet achieving a new quality of mpi system matrix recovery by deep learning baltruschat i szwargulski p griese f grosser m werner r knopp t 2020 medical image computing and computer assisted intervention miccai 2020 1 aufl springer nature switzerland 74 82 systematic modelling of the development of laminar projection origins in the cerebral cortex interactions of spatio temporal patterns of neurogenesis and cellular heterogeneity beul s hilgetag c plos comput biol 2020 16 10 e1007991 ischemic lesion growth in acute stroke water uptake quantification distinguishes between edema and tissue infarct broocks g hanning u faizy t scheibel a nawabi j schön g forkert n langner s fiehler j gellißen s kemmling a j cerebr blood f met 2020 40 4 823 832 skin lesion classification using ensembles of multi resolution efficientnets with meta data gessert n nielsen m shaikh m werner r schlaefer a methodsx 2020 7 7 100864 skin lesion classification using cnns with patch based attention and diagnosis guided loss weighting gessert n sentker t madesta f schmitz r kniep h baltruschat i werner r schlaefer a ieee t bio med eng 2020 67 2 495 503 individual differences in local functional brain connectivity affect tms effects on behavior gießing c alavash m herrmann c hilgetag c thiel c sci rep uk 2020 10 1 10422 correction improved multi parametric prediction of tissue outcome in acute ischemic stroke patients using spatial features grosser m gellißen s borchert p sedlacik j nawabi j fiehler j forkert n plos one 2020 15 3 e0230653 improved multi parametric prediction of tissue outcome in acute ischemic stroke patients using spatial features grosser m gellißen s borchert p sedlacik j nawabi j fiehler j forkert n plos one 2020 15 1 e0228113 reservoir computing for jurkat t cell segmentation in high resolution live cell ca2 fluorescence microscopy hadaeghi f diercks b wolf i werner r proc ieee isbi 2020 2020 1 1587 1591 hierarchy in the organization of brain networks hilgetag c goulas a philos t r soc b 2020 375 1796 20190319 unifying the essential concepts of biological networks biological insights and philosophical foundations kostić d hilgetag c tittgemeyer m philos t r soc b 2020 375 1796 20190314 widening the focus biomedical image segmentation challenges and the underestimated role of patch sampling and inference strategies madesta f schmitz r rösch t werner r 2020 miccai 2020 1 aufl springer nature switzerland 289 298 self contained deep learning based boosting of 4d cone beam ct reconstruction madesta f sentker t gauer t werner r med phys 2020 47 11 5619 5631 parcellation influence on the connectivity based structure function relationship in the human brain messé a hum brain mapp 2020 41 5 1167 1180 time matters handling spatio temporal perfusion information for automated tici scoring nielsen m waldmann m sentker t frölich a fiehler j werner r 2020 miccai 2020 1 aufl springer nature switzerland 86 96 segmentation based blood flow parameter refinement in cerebrovascular structures using 4 d arterial spin labeling mra phellan r lindner t helle m falcao a yasuda c sokolska m jager r forkert n ieee t bio med eng 2020 67 7 1936 1946 structural integrity of white matter tracts as a predictor of acute ischemic stroke outcome rajashekar d mouchès p fiehler j menon b goyal m demchuk a hill m dukelow s forkert n int j stroke 2020 15 9 965 972 the impact of covariates in voxel wise lesion symptom mapping rajashekar d wilms m hecker k hill m dukelow s fiehler j forkert n front neurol 2020 11 854 technological quality requirements for stereotactic radiotherapy expert review group consensus from the dgmp working group for physics and technology in stereotactic radiotherapy schmitt d blanck o gauer t fix m brunner t fleckenstein j loutfi krauss b manser p werner r wilhelm m baus w moustakis c strahlenther onkol 2020 196 5 421 443 künstliche intelligenz in der endoskopie neuronale netze und maschinelles sehen techniken und perspektiven reprint z gastroenterol 2019 57 06 767 780 schmitz r werner r rösch t endo praxis 2020 2020 36 30 43 4d ct image artifacts affect local control in sbrt of lung and liver metastases sentker t schmidt v ozga a petersen c madesta f hofmann c werner r gauer t radiother oncol 2020 148 229 234 revisiting brain modes in a new computational era approaches for the characterization of brain behavioural associations toba m godefroy o rushmore r zavaglia m maatoug r hilgetag c valero cabré a brain 2020 143 4 1088 1098 reply inhibition between human brain areas or methodological artefact toba m malherbe c godefroy o rushmore r zavaglia m maatoug r mandonnet e valero cabré a hilgetag c brain 2020 143 5 e39 game theoretical mapping of white matter contributions to visuospatial attention in stroke patients with hemineglect toba m zavaglia m malherbe c moreau t rastelli f kaglik a valabrègue r pradat diehl p hilgetag c valero cabré a hum brain mapp 2020 41 11 2926 2950 perturbation driven paradoxical facilitation of visuo spatial function revisiting the sprague effect valero cabré a toba m hilgetag c rushmore r cortex 2020 122 10 39 shaping brain structure genetic and phylogenetic axes of macroscale organization of cortical thickness valk s xu t margulies d masouleh s paquola c goulas a kochunov p smallwood j yeo b bernhardt b eickhoff s sci adv 2020 6 39 combining direct 3d volume rendering and magnetic particle imaging to advance radiation free real time 3d guidance of vascular interventions weller d salamon j frölich a möddel m knopp t werner r cardiovasc inter rad 2020 43 2 322 330 digital health meets hamburg integrated medical degree program imed concept and introduction of the new interdisciplinary 2nd track digital health werner r henningsen m schmitz r guse a augustin m gauer t gms j med edu 2020 37 6 doc61 künstliche intelligenz in der medizin werner r schmitz r 2020 digitale medizin matusiewicz d henningsen m ehlers j hrsg 1 aufl medizinisch wissenschaftliche verlagsgesellschaft 125 138 intelligent 4d ct sequence scanning i4dct first scanner prototype implementation and phantom measurements of automated breathing signal guided 4d ct werner r sentker t madesta f schwarz a vornehm m gauer t hofmann c med phys 2020 47 6 2408 2412 automatic arterial input function selection in ct and mr perfusion datasets using deep convolutional neural networks winder a d esterre c menon b fiehler j forkert n med phys 2020 47 9 4199 4211 cross species functional alignment reveals evolutionary hierarchy within the connectome xu t nenning k schwartz e hong s vogelstein j goulas a fair d schroeder c margulies d smallwood j milham m langs g neuroimage 2020 223 117346 zum forschungsportal wrestling the devil of wasting time mpi system matrix recovery by deep learning baltruschat i griese f szwargulski p werner r knopp t 2019 9th international workschop on magnetic particle imaging iwmpi 2018 1 aufl infinite science publishing neuron density fundamentally relates to architecture and connectivity of the primate cerebral cortex beul s hilgetag c neuroimage 2019 189 777 792 combining good old random forest and deeplabv3 for isles 2018 ct based stroke segmentation böhme l madesta f sentker t werner r 2019 brainlesion glioma multiple sclerosis stroke and traumatic brain injuries 1 aufl springer 335 342 altered topology of large scale structural brain networks in chronic stroke cheng b schlemm e schulz r bönstrup m messe a hilgetag c gerloff c thomalla g brain commun 2019 2019 1 1 13 topological reinforcement as a principle of modularity emergence in brain networks damicelli f hilgetag c hütt m messé a netw neurosci 2019 3 2 589 605 comparison between diffusion mri tractography and histological tract tracing of cortico cortical structural connectivity in the ferret brain delettre c messé a dell l foubet o heuer k larrat b meriaux s mangin j reillo i de juan romero c borrell v toro r hilgetag c netw neurosci 2019 3 4 1038 1050 cortical and thalamic connectivity of occipital visual cortical areas 17 18 19 and 21 of the domestic ferret mustela putorius furo dell l innocenti g hilgetag c manger p j comp neurol 2019 527 8 1293 1314 cortical and thalamic connectivity of posterior parietal visual cortical areas ppc and ppr of the domestic ferret mustela putorius furo dell l innocenti g hilgetag c manger p j comp neurol 2019 527 8 1315 1332 cortical and thalamic connectivity of temporal visual cortical areas 20a and 20b of the domestic ferret mustela putorius furo dell l innocenti g hilgetag c manger p j comp neurol 2019 527 8 1333 1347 high resolution calcium imaging method for local calcium signaling diercks b werner r schetelig d wolf i guse a 2019 calcium binding proteins of the ef hand superfamily 1 aufl humana press 27 39 spatiotemporal ontogeny of brain wiring goulas a betzel r hilgetag c sci adv 2019 5 6 eaav9694 a blueprint of mammalian cortical connectomes goulas a majka p rosa m hilgetag c plos biol 2019 17 3 e2005346 the architecture of mammalian cortical connectomes in light of the theory of the dual origin of the cerebral cortex goulas a margulies d bezgin g hilgetag c cortex 2019 118 244 261 mri based field of view selection for precise real time targeting in mpi griese f prieske m möddel m werner r knopp t 2019 9th international workshop on magnetic particle imaging iwmpi 2019 207 208 neuromorphic electronic systems for reservoir computing hadaeghi f 2019 reservoir computing springer science business media singapore private limited 221 237 spiking reservoir computing model for patient customized ecg monitoring hadaeghi f 2019 bernstein conference 2019 an architectonic type principle integrates macroscopic cortico cortical connections with intrinsic cortical circuits of the primate brain hilgetag c beul s van albada s goulas a netw neurosci 2019 3 4 905 923 radiomics of brain mri utility in prediction of metastatic tumor type kniep h madesta f schneider t hanning u schönfeld m schön g fiehler j gauer t werner r gellissen s radiology 2019 290 2 479 487 multimodal memory components and their long term dynamics identified in cortical layers ii iii but not layer v li d wang g xie h hu y guan j hilgetag c front integr neurosc 2019 13 54 discrimination of the hierarchical structure of cortical layers in 2 photon microscopy data by combined unsupervised and supervised machine learning li d zavaglia m wang g xie h hu y werner r guan j hilgetag c sci rep uk 2019 9 1 7424 self consistent deep learning based boosting of 4d cone beam computed tomography reconstruction madesta f gauer t sentker t werner r 2019 medical imaging 2019 image processing 1 aufl spie 1094902 cortical thickness and cognitive performance in asymptomatic unilateral carotid artery stenosis nickel a kessner s niebuhr a schröder j malherbe c fischer f heinze m cheng b fiehler j pinnschmidt h larena avellaneda a gerloff c thomalla g bmc cardiovasc disor 2019 19 1 154 machbarkeitsstudie zur cnn basierten identifikation und tici klassifizierung zerebraler ischämischer infarkte in dsa daten nielsen m waldmann m frölich a fiehler j werner r 2019 bildverarbeitung für die medizin 2019 1 aufl springer vieweg 200 205 over the fence media supported collaborative teaching and learning exemplified by diabetes prevention in an occupational setting preisser a hampel e riemer m kraft a zyriax b amee mededpublish 2019 8 2 künstliche intelligenz in der endoskopie neuronale netze und maschinelles sehen techniken und perspektiven schmitz r werner r rösch t z 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