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867, multiscale, ongoing, e1002937, constraints, enables, simultaneous, modules, hubs, krützelmann, 215, 218, extent, deficit, does, relate, visibility, fluid, attenuated, inversion, bravo, ding, juvenile, late, infantile, ceroid, lipofuscinosis, teach, making, 1147, diffeomorphic, blendowski, 257, range, noise, dimensionality, holmes, 0j1, incorporate, variability, 4247, fields, intensity, 1390, aligning, rigid, toussaint, maiz, coynel, souza, sarazin, habert, 778, 786, normal, ageing, entropy, 813, 819, abnormality, mca, occlusion, likelihood, later, recanalization, insight, algorithmen, systeme, anwendungen, klassifikation, verschlussgrades, epiphyse, proximalen, tibia, altersbestimmung, rosso, arbizu, ferrieux, vargas, humbert, attal, zavanone, meunier, cohen, thielscher, siebner, samson, stimul, 129, inferior, gyrus, supplementary, cathodal, tdcs, picture, naming, speed, roland, polzin, rühaak, 250, landmarks, kombination, atemsignalen, optimierung, prädiktion, komplexer, 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ase tremor exploring the finger dimmer switch theory and role of dopamine in thalamic self inhibition sadeghi f popova m páscoa dos santos f zittel s hilgetag c j neural eng 2024 21 5 benchmarking machine learning based real time respiratory signal predictors in 4d sbrt wimmert l nielsen m madesta f gauer t hofmann c werner r med phys 2024 51 5 3173 3183 impact of breathing signal guided dose modulation on step and shoot 4d ct image reconstruction wimmert l schwarz a gauer t hofmann c dickmann j sentker t werner r med phys 2024 51 10 7119 7126 darts an open source python pipeline for ca2 microdomain analysis in live cell imaging data woelk l kovacevic d husseini h förster f gerlach f möckl f altfeld m guse a diercks b werner r front immunol 2024 14 1299435 rectified activity dependent population plasticity implicates cortical adaptation for memory and cognitive functions xie h liu k li d zhang c hilgetag c guan j commun biol 2024 7 1 1487 exploring potential adhd biomarkers through advanced machine learning an examination of audiovisual integration networks zamanzadeh m pourhedayat a bakouie f hadaeghi f comput biol med 2024 183 ground truth validation of uni and multivariate lesion inference approaches zavaglia m malherbe c schlaadt s nachev p hilgetag c brain commun 2024 6 5 zum forschungsportal editorial role of brain oscillations in neurocognitive control systems baghdadi g kamarajan c hadaeghi f front syst neurosci 2023 17 1182496 from circuit principles to human psychiatric disorders barbas h hilgetag c biol psychiat 2023 93 5 388 390 discordant and converting receptor expressions in brain metastases from breast cancer mri based non invasive receptor status tracking heitkamp a madesta f amberg s wahaj s schröder t bechstein m meyer l broocks g hanning u gauer t werner r fiehler j gellißen s kniep h cancers 2023 15 11 label efficient classification in liquid biopsy data by self supervision husseini h nielsen m pantel k wikman h riethdorf s werner r 2023 bildverarbeitung für die medizin 2023 deserno t handels h maier a maier hein k palm c tolxdorff t hrsg 1 aufl springer vieweg 261 266 structural basis of envelope and phase intrinsic coupling modes in the cerebral cortex messé a hollensteiner k delettre c dell brown l pieper f nentwig l galindo leon e larrat b mériaux s mangin j reillo i juan romero c borrell v engler g toro r engel a hilgetag c neuroimage 2023 276 simulation of neuroplasticity in a cnn based in silico model of neurodegeneration of the visual system moore j wilms m gutierrez a ismail z fakhar k hadaeghi f hilgetag c forkert n front comput neurosc 2023 17 1274824 self supervision for medical image classification state of the art performance with 100 labeled training samples per class nielsen m wenderoth l sentker t werner r bioengineering basel 2023 10 8 a topology based computational framework to assess the effect of deep brain stimulation in the context of freezing of gait in parkinson s disease popova m messe a gulberti a gerloff c pötter nerger m hilgetag c clin neurophysiol 2023 148 e61 e62 dose reduction in sequence scanning 4d ct imaging through respiratory signal guided tube current modulation a feasibility study schwarz a werner r wimmert l vornehm m gauer t hofmann c med phys 2023 50 12 7539 7547 extending tempcyclegan for virtual augmentation of gastrointestinal endoscopy training simulators wallrodt m schulz alsen m ehlken h rösch t schmitz r werner r 2023 bildverarbeitung für die medizin 2023 deserno t handels h maier a maier hein k palm c tolxdorff t hrsg 1 aufl springer vieweg 3 8 adhesion to laminin 1 and collagen iv induces the formation of ca2 microdomains that sensitize mouse t cells for activation weiß m hernandez l gil montoya d löhndorf a krüger a kopdag m uebler l landwehr m nawrocki m huber s woelk l werner r failla a flügel a dupont g guse a diercks b sci signal 2023 16 790 eabn9405 clinical application of breathing adapted 4d ct image quality comparison to conventional 4d ct werner r szkitsak j madesta f büttgen l wimmert l sentker t fietkau r haderlein m bert c gauer t hofmann c strahlenther onkol 2023 199 7 686 691 zum forschungsportal heterogeneous reservoir computing models for persian speech recognition ansari z pourhoseini f hadaeghi f international joint conference on neural networks ijcnn 2022 2022 1 7 high frequency oscillations and sequence generation in two population models of hippocampal region ca1 braun w memmesheimer r plos comput biol 2022 18 2 p2x4 and p2x7 are essential players in basal t cell activity and ca2 signaling milliseconds after t cell activation brock v wolf i er lukowiak m lory n stähler t woelk l mittrücker h müller c koch nolte f rissiek b werner r guse a diercks b sci adv 2022 8 5 disentangling cortical functional connectivity strength and topography reveals divergent roles of genes and environment burger b nenning k schwartz e margulies d goulas a liu h neubauer s dauwels j prayer d langs g neuroimage 2022 247 brain connectivity meets reservoir computing damicelli f hilgetag c goulas a plos comput biol 2022 18 11 causal influences decouple from their underlying network structure in echo state networks fakhar k hadaeghi f hilgetag c 2022 2022 international joint conference on neural networks ijcnn 1 aufl piscataway nj ieee 1 8 systematic perturbation of an artificial neural network a step towards quantifying causal contributions in the brain fakhar k hilgetag c plos comput biol 2022 18 6 intrinsic functional brain connectivity is resilient to chronic hypoperfusion caused by unilateral carotid artery stenosis fischer f malherbe c schlemm e schröder j heinze m cheng b schulz m fiehler j larena avellaneda a gerloff c thomalla g neuroimage clin 2022 34 103014 a natural cortical axis connecting the outside and inside of the human brain hilgetag c goulas a changeux j netw neurosci 2022 6 4 950 959 the highways and byways of the brain hilgetag c zikopoulos b plos biol 2022 20 3 e3001612 δfosb accumulation in hippocampal granule cells drives cfos pattern separation during spatial learning lamothe molina p franzelin a beck l li d auksutat l fieblinger t laprell l alhbeck j gee c kneussel m engel a hilgetag c morellini f oertner t nat commun 2022 13 1 one region to control them all the surprising effectiveness of network control theory in predicting post stroke recovery from aphasia popova m fakhar k braun w front comput neurosc 2022 16 943396 evaluation of magnetic resonance imaging based radiomics characteristics for differentiation of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors in neurofibromatosis type 1 ristow i madesta f well l shenas f wright f molwitz i farschtschi s bannas p adam g mautner v werner r salamon j neuro oncology 2022 24 10 1790 1798 brain simulation as a cloud service the virtual brain on ebrains schirner m domide l perdikis d triebkorn p stefanovski l pai r prodan p valean b palmer j langford c blickensdörfer a van der vlag m diaz pier s peyser a klijn w pleiter d nahm a schmid o woodman m zehl l fousek j petkoski s kusch l hashemi m marinazzo d mangin j flöel a akintoye s stahl b cepic m johnson e deco g mcintosh a hilgetag c morgan m schuller b upton a mcmurtrie c dickscheid t bjaalie j amunts k mersmann j jirsa v ritter p neuroimage 2022 251 reaction diffusion models in weighted and directed connectomes schmitt o nitzsche c eipert p prathapan v hütt m hilgetag c plos comput biol 2022 18 10 artificial intelligence in gi endoscopy stumbling blocks gold standards and the role of endoscopy societies schmitz r werner r repici a bisschops r meining a zornow m messmann h hassan c sharma p rösch t gut 2022 71 3 451 454 association of age and structural brain changes with functional connectivity and executive function in a middle aged to older population based cohort schulz m mayer c schlemm e frey b malherbe c petersen m gallinat j kühn s fiehler j hanning u twerenbold r gerloff c cheng b thomalla g front aging neurosci 2022 14 reinforcement learning basierte patchpriorisierung zur beschleunigten segmentierung von hochauflösenden endoskopievideodaten schüttler s madesta f rösch t werner r schmitz r 2022 informatik aktuell bildverarbeitung für die medizin klaus m deserno t handels h maier a palm c tolxdorff t hrsg 1 aufl wiesbaden springer vieweg 339 344 task specific subnetworks extend from prefrontal cortex to striatum stiers p goulas a cortex 2022 156 106 125 bringing anatomical information into neuronal network models van albada s morales gregorio a dickscheid t goulas a bakker r bludau s palm g hilgetag c diesmann m 2022 computational modelling of the brain giugliano m negrello m linaro d hrsg 1 aufl 201 234 dekonvolution von mikroskopiedaten bei niedrigem signal rausch verhältnis woelk l diercks b werner r biospektrum 2022 2022 28 720 722 zum forschungsportal reduktion der kalibrierungszeit für die magnetpartikelbildgebung mittels deep learning baltruschat i szwargulski p griese f grosser m werner r knopp t 2021 bildverarbeitung für die medizin 2021 proceedings german workshop on medical image computing 2021 palm c handels h maier hein k deserno t maier a tolxdorff t hrsg springer science and business media deutschland gmbh 337 an architectonic type principle in the development of laminar patterns of cortico cortical connections beul s goulas a hilgetag c brain struct funct 2021 226 4 979 987 a connectomic hypothesis for the hominization of the brain changeux j goulas a hilgetag c cereb cortex 2021 31 5 2425 2449 imaging evolution of the primate brain the next frontier friedrich p forkel s amiez c balsters j coulon o fan l goulas a hadj bouziane f hecht e heuer k jiang t latzman r liu x loh k patil k lopez persem a procyk e sallet j toro r vickery s weis s wilson c xu t zerbi v eickoff s margulies d mars r thiebaut de schotten m neuroimage 2021 228 117685 the natural axis of transmitter receptor distribution in the human cerebral cortex goulas a changeux j wagstyl k amunts k palomero gallagher n hilgetag c p natl acad sci usa 2021 118 3 bio instantiated recurrent neural networks integrating neurobiology based network topology in artificial networks goulas a damicelli f hilgetag c neural networks 2021 142 608 618 dual nadph oxidases duox1 and duox2 synthesize naadp and are necessary for ca2 signaling during t cell activation gu f krüger a roggenkamp h alpers r lodygin d jaquet v möckl f hernandez c l winterberg k bauche a rosche a grasberger h kao j schetelig d werner r schröder k carty m bowie a huber s meier c mittrücker h heeren j krause k flügel a diercks b guse a sci signal 2021 14 709 spatio temporal feature learning with reservoir computing for t cell segmentation in live cell ca2 fluorescence microscopy hadaeghi f diercks b schetelig d damicelli f wolf i werner r sci rep uk 2021 11 1 paip 2019 liver cancer segmentation challenge kim y jang h lee k park s min s hong c park j lee k kim j hong w jung h liu y rajkumar h khened m krishnamurthi g yang s wang x han c kwak j ma j tang z marami b zeineh j zhao z heng p schmitz r madesta f rösch t werner r tian j puybareau e bovio m zhang x zhu y chun s jeong w park p choi j med image anal 2021 67 101854 single image based vignetting correction for improving the consistency of neural activity analysis in 2 photon functional microscopy li d wang g werner r xie h guan j hilgetag c front neuroinform 2021 15 674439 game theoretical mapping of fundamental brain functions based on lesion deficits in acute stroke malherbe c cheng b königsberg a cho t ebinger m endres m fiebach j fiehler j galinovic i puig j thijs v lemmens r muir k nighoghossian n pedraza s simonsen c wouters a gerloff c hilgetag c thomalla g brain commun 2021 3 3 fcab204 deep learning based automated thrombolysis in cerebral infarction scoring a timely proof of principle study nielsen m waldmann m frölich a flottmann f hristova e bendszus m seker f fiehler j sentker t werner r stroke 2021 52 11 3497 3504 modelling the effect of deep brain stimulation on cortico subcortical networks in the context of freezing of gait in parkinson s disease popova m messe a gulberti a pötter nerger m hilgetag c j comput neurosci 2021 2021 49 s86 hn1l jpt2 a signaling protein that connects naadp generation to ca2 microdomain formation roggenkamp h khansahib i hernandez c l zhang y lodygin d krüger a gu f möckl f löhndorf a wolters v woike d rosche a bauche a schetelig d werner r schlüter h failla a meier c fliegert r walseth t flügel a diercks b guse a sci signal 2021 14 675 multi scale fully convolutional neural networks for histopathology image segmentation from nuclear aberrations to the global tissue architecture schmitz r madesta f nielsen m krause j steurer s werner r rösch t med image anal 2021 70 101996 functional connectivity changes in cerebral small vessel disease a systematic review of the resting state mri literature schulz m malherbe c cheng b thomalla g schlemm e bmc med 2021 19 1 103 first clinical evaluation of breathing controlled four dimensional computed tomography imaging szkitsak j werner r fernolendt s schwarz a ott o fietkau r hofmann c bert c phys imag radiat onc 2021 20 56 61 two classes of functional connectivity in dynamical processes in networks voutsa v battaglia d bracken l brovelli a costescu j díaz muñoz m fath b funk a guirro m hein t kerschner c kimmich c lima v messé a parsons a perez j pöppl r prell c recinos s shi y tiwari s turnbull l wainwright j waxenecker h hütt m j r soc interface 2021 18 183 20210486 comparison of intelligent 4d ct sequence scanning and conventional spiral 4d ct a first comprehensive phantom study werner r szkitsak j sentker t madesta f schwarz a fernolendt s vornehm m gauer t bert c hofmann c phys med biol 2021 66 1 time dependent image restoration of low snr live cell ca2 fluorescence microscopy data woelk l kannabiran s brock v gee c lohr c guse a diercks b werner r int j mol sci 2021 22 zum forschungsportal 3d smrnet achieving a new quality of mpi system matrix recovery by deep learning baltruschat i szwargulski p griese f grosser m werner r knopp t 2020 medical image computing and computer assisted intervention miccai 2020 1 aufl springer nature switzerland 74 82 systematic modelling of the development of laminar projection origins in the cerebral cortex interactions of spatio temporal patterns of neurogenesis and cellular heterogeneity beul s hilgetag c plos comput biol 2020 16 10 e1007991 ischemic lesion growth in acute stroke water uptake quantification distinguishes between edema and tissue infarct broocks g hanning u faizy t scheibel a nawabi j schön g forkert n langner s fiehler j gellißen s kemmling a j cerebr blood f met 2020 40 4 823 832 skin lesion classification using ensembles of multi resolution efficientnets with meta data gessert n nielsen m shaikh m werner r schlaefer a methodsx 2020 7 7 100864 skin lesion classification using cnns with patch based attention and diagnosis guided loss weighting gessert n 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